A bioinformatika területeinek, például a szekvenciaelemzéseknek, strukturális modellezésnek, rendszerbiológiának, klinikai genomikának, farmakogenomikának közös jellemzője a szoftvereszközök, web-szolgáltatások, illetve adat- és tudásbázisok sokasága. Az elméleti alapok, algoritmikus problémák megismerése mellett egyre nagyobb hangsúlyt kap az ipari alkalmazás és integráció. A tárgy alapvető eszközök használatát ismerteti, és arra ad lehetőséget, hogy a hallgatók már létező megoldásokról személyes tapasztalatot szerezzenek. A tárgy célkitűzése szerint ez mind akár a korábban megszerzett tudásnak az elmélyítését elősegítheti, vagy éppen a gyakorlattól kiindulva további elméleti ismeretek megszerzésére is sarkallhat.

A laborfoglalkozásokon a következő témákhoz tartozó szoftvereszközök használata lesz bemutatva:

1. Szekvenciaillesztés
2. Motívumkeresés
3. Filogenetika faépítés
4. Újgenerációs szekvenálási adatok: genomösszeállítás
5. Újgenerációs szekvenálási adatok: genetikai variánsok detekciója
6. Génprioritizálás
7. SNP prioritizálás, kísérlettervezés
8. Genomikai adatok előkészítése, normalizációja
9. Genetikai asszociációs elemzések
10. Génexpressziós adatok elemzése
11. Omikai adatok útvonal elemzése
12. Oksági elemzés
13. Diagnosztikai és döntéstámogató modellek építése
14. Bioinformatikai nyelvek és munkafolyamatrendszerek

a.       A szorgalmi időszakban: laborgyakorlatonkénti számonkéréssel és teljesítéssel, amelyre a hallgatók jegyet kapnak. A jegyek átlaga határozza meg az évvégi osztályzatot.

b.       A vizsgaidőszakban: -

c.              Elővizsga: -

Az évvégi osztályzatot a félév során kapott jegyek átlaga határozza meg.

Három alkalom pótlása lehetséges.

Igény szerint.